محمد اربابي دوره ابتدايي را در مدرسه 22 بهمن تربت جام گذراند و پس از آن دوره راهنمايي را در مدرسه راهنمايي شهيد بهشتي همان شهر طي کرد. در دوره راهنمايي درس‌هاي سال دوم را در تابستان سال 1368 مطالعه کرد و به صورت جهشي وارد پايه سوم شد و در همان سال در ميان دانش آموزان شهرستان تربت جام رتبه نخست علمي را کسب کرد . ادامه تحصيلات را در دبيرستان مالک اشتر، ناحيه سه مشهد ادامه داد و سال دوم دبيرستان در رشته تجربي رتبه نخست آزمون‌هاي علمي شهرستان مشهد را به‌دست آورد. در سال 1373 با کسب رتبه يک از دبيرستان مالک اشتر فارغ‌التحصيل شد و رشته پزشکي را در دانشگاه علوم پزشکي زاهدان شروع کرد. پس از تحصيل در رشته پزشکي، با کسب رتبه يک دانش آموختگان سال 1380، در رشته روان پزشکي دانشگاه علوم پزشکي شهيد بهشتي تحصيلات تخصصي خود را آغاز کرد و در سال 1383 با کسب رتبه يک دانشگاه و رتبه برتر آزمون دانشنامه در سطح کشور، مدرک دکتراي تخصصي روان پزشکي را دريافت کرد. سپس در همان سال به عنوان استاديار روان پزشکي در دانشگاه علوم پزشکي تهران شروع به فعاليت کرد. دراين دانشگاه علاوه بر تدريس در دانشکده پزشکي و آموزش دانشجويان پزشکي و دستياران روان پزشکي، در راه اندازي بخش روان تني بيمارستان امام خميني و فلوشيپ روان تني نقش مؤثري داشته و همزمان در انجمن علمي روان پزشکان ايران دو دوره به عنوان دبير علمي همايش ساليانه مسئوليت داشت. دکتر محمداربابي ضمن حضور مستمر در فعاليت‌هاي علمي انجمن علمي روان پزشکان ايران، در سال 1388 به اتفاق همکاران شان کميته عصب روان پزشکي انجمن روان پزشکان ايران را تأسيس کردند. درهمان سال به عنوان فعال نمونه سلامت روان در کشور برگزيده شد و در سال 1391 در دانشگاه تهران به مرتبه دانشياري ارتقاء پيدا کرد. درسال ۱۳۹۵ با همکاري جمعي از استادان پزشکي روان تني در ايران انجمن علمي پزشکي روان تني ايران را پايه گذاري کردند. دکترمحمداربابي به منظور مطالعه و تحقيق در رشته علوم اعصاب، در سال 1396 در دانشگاه سنت جرجز لندن دوره فلوشيپ عصب روان پزشکي را گذراند و پس از بازگشت به ايران، با همکاري استادان دانشگاه علوم پزشکي تهران دوره تخصصي فلوشيپ عصب روان پزشکي را راه اندازي کردند. علاوه بر فعاليت در سطح ملي، وي عضو هيئت مديره دپارتمان سايکونوروبيولوژي در انجمن جهاني روان پزشکان مي‌باشد و در کميته علمي کنگره انجمن جهاني آلزايمر به عنوان عضو فعاليت مي‌کند.دکترمحمد اربابي درسال ۱۳۹۹علاوه برانتخاب به عنوان استاد نمونه دانشکده پزشکي،درجه استادي دانشگاه علوم پزشکي تهران رادريافت کرد. دکترمحمداربابي علاوه بر ارائه ۲۶ مقاله در کنگره‌هاي بين‌المللي، عضو انجمن عصب روان پزشکي بريتانيا مي‌باشد. حاصل تلاش‌هاي ايشان در انجمن روان پزشکان برگزيده شدن کميته عصب روان پزشکي اين انجمن به عنوان کميته برتر اين انجمن بوده است. درطي اين ساليان دکترمحمداربابي خود رامديون حمايت هاي خانواده وآموخته هاي يکايک استادان خود مي داند و از استاد دکتراحمدجليلي به عنوان نمونه اين معلمان فرهيخته، قدرداني مي کند. نتيجه فعاليت هاي علمي دکتر محمد اربابي تاکنون انتشار ۷۷ مقاله در عرصه بين‌المللي و انتشار چهار کتاب ازجمله کتاب تاريخ روان پزشکي در ايران مي‌باشد که در دسترس علاقه‌مندان قرار دارد.